Seuls quelques individus hivernent. Le Faucon émerillon est surtout observé aux passages pré- et post-nuptiaux. Compte tenu de sa présence hivernale, aucun comptage n’a encore été effectué sur cette espèce. Seules des observations occasionnelles peuvent être faites en hiver. Un protocole comme celui appliqué aux busards pourrait être envisagé en hiver pour détecter et estimer le nombre d’individus en hivernage dans la zone. Néanmoins, la petite taille de ce rapace et sa grande mobilité ne facilitent pas son observation.
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